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So ziemlich alle anklickbaren Links im Shop verweisen auf die oben genannte Fehlerseite. Also egal, ob man unter Informationen “Versand und Kosten”, “Widerrufsrecht” usw. besuchen will oder die oben angezeigten Kategorien sehen möchte, es geht nichts.
Die im Fehlerdokument “hier” verlinkte URL zweigt auf die http://shop.meinedomain.de/cms/oxid/oxseo.php/, ändert sich aber nichts beim anklicken.

Einzig wenn man die Kategorien über das Suchfeld bei der Artikelsuche angibt, kommt man auf die entsprechende Seite. man kann auch Artikel in den Warenkorb legen usw.
Die einzelnen (fehlerhaften?) Links scheinen SEO-Links zu sein, da sie auf entsprechende Dinge wie \Datenschutz\ oder \Versand-und-Kosten\ verweisen.

Da scheint irgendwo eine falsche Einstellung zu sein, kann mir keiner helfen?

Community Edition 4.2.0_23610

Also in einem anderen Thread habe ich folgendes gefunden:
$this->blSeoMode = false;

Damit geht es aber warum geht es mit SEO dann nicht, wo ist der Fehler?

eventuell hast du in der seo tabelle falsche links etc hinterlegt. lösch doch einfach mal den inhalt der oxseo table und lass die seo links neu aufbauen