Das Setup müsste sich auch neu starten lassen indem du die Datei config.inc.php durch die Version in \vendor\oxid-esales\oxideshop-ce\source\config.inc.php.dist ersetzt und die Berechtigung von .htaccess und config.inc.php auf 444 stellst.
Wegen dem weissen Fenster könnte es sein dass du Opfer dieses Bugs wurdest: https://bugs.oxid-esales.com/view.php?id=6747. Wenn du sicher gehen willst kannst du dieses Skript in eine Datei packen (test.php) und im Browser aufrufen:
<?php
echo "test";
$stdout = fopen('php://stdout', 'w');
fwrite($stdout, "stdout");
Wenn du dann “teststdout” siehst musst du eine Datei patchen vor dem Setup.