Du hattest unter ::before Fehler bei Subdomain (V.6) - #13 by webchallenge erwähnt
Die Hauptdomain direkt in den Source-Ordner lenken.
Dies würde ich so verstehen, dass Dein Hoster den Document-Root Pfad auf /store/source/ Verzeichnis bei Dir gesetzt hat.
Dann müssten in der config.inc.php die Shop Variablen wie folgt lauten:
$this->sShopURL = 'https://domain.de'; // eShop base url, required
$this->sSSLShopURL = 'https://domain.de'; // eShop SSL url, optional
$this->sAdminSSLURL = 'https://domain.de/admin'; // eShop Admin SSL url, optional
Nach der Änderungen sollten die Rechte der config.inc.php auf 444 gesetzt werden, damit im Shop Admin auch keine Meldung kommt.